Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Exosc9Q9JHI7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Exosc9Q9JHI7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms