Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cxcl11Q9JHH5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cxcl11Q9JHH5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms