Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tcirg1Q9JHF5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms