Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim54Q9ERP3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim54Q9ERP3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim54Q9ERP3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim54Q9ERP3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim54Q9ERP3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim54Q9ERP3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim54Q9ERP3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim54Q9ERP3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trim54Q9ERP3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim54Q9ERP3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim54Q9ERP3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim54Q9ERP3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim54Q9ERP3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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