Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cse1lQ9ERK4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cse1lQ9ERK4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms