Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tfip11Q9ERA6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms