Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms