Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpsf1Q9EPU4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpsf1Q9EPU4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpsf1Q9EPU4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpsf1Q9EPU4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpsf1Q9EPU4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpsf1Q9EPU4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpsf1Q9EPU4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpsf1Q9EPU4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpsf1Q9EPU4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cpsf1Q9EPU4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cpsf1Q9EPU4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cpsf1Q9EPU4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpsf1Q9EPU4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpsf1Q9EPU4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms