Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnf6Q9DBU5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf6Q9DBU5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms