Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms