Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cyp27a1Q9DBG1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp27a1Q9DBG1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms