Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc54Q9DAL3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms