Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem239Q9DA47 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tmem239Q9DA47 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms