Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg7Q9D906 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms