Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnot8Q9D8X5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms