Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hm13Q9D8V0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hm13Q9D8V0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hm13Q9D8V0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hm13Q9D8V0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hm13Q9D8V0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Hm13Q9D8V0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hm13Q9D8V0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hm13Q9D8V0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hm13Q9D8V0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hm13Q9D8V0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hm13Q9D8V0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hm13Q9D8V0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms