Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rexo2Q9D8S4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms