Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lin37Q9D8N6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms