Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Alkbh4Q9D8F1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms