Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Jam3Q9D8B7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Jam3Q9D8B7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jam3Q9D8B7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jam3Q9D8B7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jam3Q9D8B7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jam3Q9D8B7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jam3Q9D8B7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jam3Q9D8B7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jam3Q9D8B7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Jam3Q9D8B7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Jam3Q9D8B7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Jam3Q9D8B7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Jam3Q9D8B7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Jam3Q9D8B7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Jam3Q9D8B7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms