Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Capns2Q9D7J7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Capns2Q9D7J7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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