Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D7E4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q9D7E4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms