Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cmtm5Q9D6G9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cmtm5Q9D6G9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms