Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc81Q9D5W4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc81Q9D5W4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms