Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PudpQ9D5U5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms