Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spsb1Q9D5L7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms