Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4931423N10RikQ9D4J9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4931423N10RikQ9D4J9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931423N10RikQ9D4J9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms