Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf6Q9D4J7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms