Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubgcp4Q9D4F8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubgcp4Q9D4F8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms