Protein–RNA interactions for Protein: Q9D476

4933407L21Rik, RIKEN cDNA 4933407L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933407L21RikQ9D476 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4933407L21RikQ9D476 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms