Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gpn3Q9D3W4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gpn3Q9D3W4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms