Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc8Q9D2H8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc8Q9D2H8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms