Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lsm12Q9D0R8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lsm12Q9D0R8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms