Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdca7Q9D0M2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdca7Q9D0M2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms