Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
3100002H09RikQ9CXW6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
3100002H09RikQ9CXW6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms