Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem50aQ9CXL1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem50aQ9CXL1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms