Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CWU4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CWU4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CWU4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CWU4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q9CWU4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CWU4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CWU4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q9CWU4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CWU4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CWU4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CWU4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CWU4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CWU4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9CWU4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CWU4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CWU4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CWU4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms