Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP8

Pold4, DNA polymerase delta subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold4Q9CWP8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold4Q9CWP8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold4Q9CWP8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold4Q9CWP8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold4Q9CWP8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold4Q9CWP8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold4Q9CWP8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold4Q9CWP8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pold4Q9CWP8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pold4Q9CWP8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pold4Q9CWP8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pold4Q9CWP8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pold4Q9CWP8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pold4Q9CWP8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pold4Q9CWP8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold4Q9CWP8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold4Q9CWP8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold4Q9CWP8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold4Q9CWP8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold4Q9CWP8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold4Q9CWP8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold4Q9CWP8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pold4Q9CWP8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms