Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms