Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Otud1Q9CUB6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud1Q9CUB6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms