Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rhobtb3Q9CTN4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rhobtb3Q9CTN4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms