Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT9

Uncharacterized protein C20orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQT9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CQT9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQT9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQT9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CQT9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms