Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Smim8Q9CQQ0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim8Q9CQQ0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms