Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trappc2Q9CQP2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc2Q9CQP2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms