Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rdm1Q9CQK3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rdm1Q9CQK3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms