Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mrpl11Q9CQF0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mrpl11Q9CQF0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms