Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTRAFQ9CQE8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTRAFQ9CQE8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms