Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms