Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Med4Q9CQA5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med4Q9CQA5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms