Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pkp2Q9CQ73 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pkp2Q9CQ73 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms